تأسس القسم في العام الجامعي 2019-2020 م ويعتبر قسم طب العيون أحد اهم الاقسام في المرحلة السريرية ,بدأت العملية التعليمية بالتعاون من اعضاء هيئه التدريس بقسم طب العيون كلية الطب البشري بجامعة طرابلس وتدرس مادة طب العيون في المرحلة الثالثة (السنه الرابعة).